Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAX2Q9UIW0 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
VAX2Q9UIW0 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.1 ms