Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RTN1Q16799 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
RTN1Q16799 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 369.7 ms