Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PRKD1Q15139 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PRKD1Q15139 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PRKD1Q15139 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PRKD1Q15139 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PRKD1Q15139 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PRKD1Q15139 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PRKD1Q15139 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PRKD1Q15139 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PRKD1Q15139 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PRKD1Q15139 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
PRKD1Q15139 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRKD1Q15139 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRKD1Q15139 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRKD1Q15139 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRKD1Q15139 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRKD1Q15139 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRKD1Q15139 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRKD1Q15139 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.6 ms