Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERPUD2Q9BSE4 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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