Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC1

VPS39, Vam6/Vps39-like protein, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS39Q96JC1 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VPS39Q96JC1 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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VPS39Q96JC1 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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VPS39Q96JC1 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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VPS39Q96JC1 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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VPS39Q96JC1 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPS39Q96JC1 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPS39Q96JC1 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPS39Q96JC1 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPS39Q96JC1 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPS39Q96JC1 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPS39Q96JC1 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPS39Q96JC1 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VPS39Q96JC1 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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