Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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SP140Q13342 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SP140Q13342 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SP140Q13342 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SP140Q13342 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SP140Q13342 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SP140Q13342 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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SP140Q13342 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SP140Q13342 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SP140Q13342 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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SP140Q13342 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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SP140Q13342 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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SP140Q13342 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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SP140Q13342 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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SP140Q13342 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SP140Q13342 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP140Q13342 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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SP140Q13342 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP140Q13342 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
SP140Q13342 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SP140Q13342 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP140Q13342 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP140Q13342 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP140Q13342 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP140Q13342 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP140Q13342 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP140Q13342 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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