Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms