Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd2V9GX34 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd2V9GX34 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd2V9GX34 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd2V9GX34 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd2V9GX34 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd2V9GX34 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd2V9GX34 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd2V9GX34 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd2V9GX34 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd2V9GX34 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd2V9GX34 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd2V9GX34 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd2V9GX34 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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