Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd1Q9Z2E2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms