Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdpk1Q9Z2A0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdpk1Q9Z2A0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdpk1Q9Z2A0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdpk1Q9Z2A0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms