Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccne2Q9Z238 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms