Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trip6Q9Z1Y4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trip6Q9Z1Y4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trip6Q9Z1Y4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms