Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms