Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L1

S1pr4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr4Q9Z0L1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
S1pr4Q9Z0L1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
S1pr4Q9Z0L1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms