Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lemd3Q9WU40 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lemd3Q9WU40 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms