Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms