Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms