Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TapbpQ9R233 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TapbpQ9R233 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TapbpQ9R233 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TapbpQ9R233 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TapbpQ9R233 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TapbpQ9R233 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TapbpQ9R233 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TapbpQ9R233 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TapbpQ9R233 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TapbpQ9R233 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TapbpQ9R233 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TapbpQ9R233 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TapbpQ9R233 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TapbpQ9R233 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TapbpQ9R233 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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