Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubd1Q9R1K7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubd1Q9R1K7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubd1Q9R1K7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubd1Q9R1K7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubd1Q9R1K7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubd1Q9R1K7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubd1Q9R1K7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubd1Q9R1K7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubd1Q9R1K7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubd1Q9R1K7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubd1Q9R1K7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubd1Q9R1K7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubd1Q9R1K7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms