Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plod3Q9R0E1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms