Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nek3Q9R0A5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms