Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms