Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc3Q9QZC1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms