Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms