Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2e3Q9QXZ7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms