Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nufip1Q9QXX8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms