Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms