Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms