Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a1Q9QX15 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms