Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyth1Q9QX11 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyth1Q9QX11 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms