Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk1eQ9JMK2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms