Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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FancaQ9JL70 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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FancaQ9JL70 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancaQ9JL70 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms