Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgn5Q9JL35 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms