Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms