Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Habp4Q9JKS5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms