Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms