Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms