Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfhx4Q9JJN2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms