Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EefsecQ9JHW4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EefsecQ9JHW4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms