Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ClpxQ9JHS4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ClpxQ9JHS4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ClpxQ9JHS4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ClpxQ9JHS4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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