Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Tmod3Q9JHJ0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Tmod3Q9JHJ0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Tmod3Q9JHJ0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Tmod3Q9JHJ0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Tmod3Q9JHJ0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Tmod3Q9JHJ0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Tmod3Q9JHJ0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Tmod3Q9JHJ0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Tmod3Q9JHJ0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Tmod3Q9JHJ0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Tmod3Q9JHJ0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Tmod3Q9JHJ0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod3Q9JHJ0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod3Q9JHJ0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod3Q9JHJ0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod3Q9JHJ0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod3Q9JHJ0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod3Q9JHJ0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod3Q9JHJ0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod3Q9JHJ0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod3Q9JHJ0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod3Q9JHJ0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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