Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET52

Cts6, Cathepsin-6, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts6Q9ET52 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cts6Q9ET52 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cts6Q9ET52 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms