Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cse1lQ9ERK4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cse1lQ9ERK4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms