Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc28a3Q9ERH8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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