Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dap3Q9ER88 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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