Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1aQ9EPL5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms