Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms