Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Csnk1dQ9DC28 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms