Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms