Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ftsj3Q9DBE9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms